Quel est le meilleur logiciel pour expert-comptable en 2025 ? Top 13

Vous avez du mal à vous y retrouver dans la jungle des logiciels pour cabinets comptables ? Vous n’êtes pas le seul ! Pourtant, le choix de votre outil de production comptable n’est pas anodin : c’est lui qui va rythmer votre quotidien, structurer vos process et (soyons honnêtes) vous faire surtout gagner beaucoup de temps. Alors, quel est le meilleur logiciel pour expert-comptable ? Découvrons ensemble 13 logiciels plébiscités par votre profession ! 

Quelles fonctionnalités rechercher dans un logiciel pour expert-comptable ?

Votre logiciel comptable devient rapidement la colonne vertébrale de votre cabinet. Pour qu’il vous accompagne au mieux et le plus longtemps possible, il vous faut donc retrouver quelques fonctionnalités incontournables : 

• Automatisation de la saisie : connexion bancaire, OCR, génération automatique des écritures pour limiter les saisies manuelles.
• Révision assistée : modules pour identifier rapidement anomalies, cycles incomplets ou incohérences avant la clôture.
• Tableaux de bord en temps réel : suivi instantané de la trésorerie, des marges ou de l’avancement des dossiers, sans devoir faire d’exports Excel.
• Portail client collaboratif : espace dédié pour déposer, partager et valider les documents afin de réduire les allers-retours par mail ou la perte de pièces justificatives.
• Planification et suivi des missions : vision claire des échéances, des tâches et du temps passé pour mieux répartir la charge de travail et prévenir les retards.
• CRM intégré : gestion des lettres de mission, suivi des relances et de la relation client au même endroit.
• Conformité intégrée : prise en charge native de la facturation électronique, mises à jour fiscales automatiques, RGPD respecté.

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Top 13 des meilleurs logiciels pour cabinet et expert-comptable en 2025

L’outil parfait n’existe peut-être pas, mais certaines solutions se démarquent clairement ! Voici notre sélection des 13 meilleurs logiciels pour cabinet comptable du moment, dans lesquels vous pourrez choisir celui qui vous convient.

1. Pennylane

Pennylane vous donne la possibilité de gérer la comptabilité de vos clients ET leur pilotage financier depuis une seule plateforme. Ce logiciel pour cabinet comptable automatise tout : 

• la saisie comptable ; 
• la centralisation des factures, justificatifs et notes de frais ;
• la génération des écritures comptables ; 
• les révisions grâce à des cycles clairs et une détection des écarts. 

La synchronisation bancaire est fluide, le rapprochement automatique. Vos clients peuvent aussi suivre leur trésorerie ou gérer leurs ventes directement depuis l’interface.

Compatible Factur-X, Pennylane est connecté à l’écosystème des outils SaaS : il propose donc une approche moderne et efficace de la compta (sans gestion de la paie, mais avec des intégrations comme Payfit).

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2. Sage 

Sage accompagne les cabinets comptables grâce à une suite d’outils développés pour la production, la gestion interne et la relation client.

Avec Sage for Accountants, vous serez en mesure de centraliser la facturation électronique, d’automatiser la saisie (via AutoEntry) et de structurer vos process avec un espace client dédié. 

La version Génération Experts intègre aussi un CRM, la paie, les déclarations fiscales et sociales, ainsi qu’un suivi d’activité précis. Le tout comprend un très bon accompagnement et le respect des normes françaises. 

3. EBP Comptabilité

EBP Comptabilité s’adresse aux cabinets à la recherche d’un outil simple, efficace et fiable pour accompagner leurs clients TPE et PME. Ce logiciel de comptabilité pour expert-comptable se charge de la saisie des données via la synchronisation bancaire, tandis que les écritures sont générées et classées en automatique. 

La compta analytique vous donne une vision claire par projet, client ou centre de coûts. Vous suivez ainsi leur rentabilité en temps réel, anticipez leurs besoins de trésorerie et gagnez en réactivité. Et cette solution vient avec des mises à jour légales intégrées et un vrai support technique derrière !

4. Dext 

Avec Dext, vos clients prennent simplement en photo leurs factures ou tickets : la solution extrait ensuite les infos clés (date, TVA, montant) et les envoie directement dans votre logiciel comptable, qui automatise les rapprochements. Et l’écosystème Dext va bien plus loin : 

• Dext Prepare centralise tous les justificatifs ; 
• Dext Precision vous aide à auditer, détecter les anomalies et fiabiliser les données ;
• Dext Commerce automatise les flux issus des marketplaces et outils de paiement.

Ce logiciel pour expert-comptable est d’ailleurs compatible avec Sage, QuickBooks, Xero : il est pensé par et pour les cabinets de comptabilité. Plus de 6 000 utilisateurs l’ont déjà adopté et l’outil ne cesse d’enrichir ses fonctionnalités grâce à l’intelligence artificielle.

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5. Akuiteo

Pensé pour les cabinets pilotés par missions, Akuiteo dépasse le rôle du simple logiciel comptable. Cet outil est disponible en SaaS, en location ou en installation locale : il est très complet puisqu’il regroupe comptabilité, facturation, CRM, trésorerie, GED et planification dans une seule interface ! 

Ce logiciel de comptabilité pour expert-comptable permet de piloter plusieurs sociétés, de suivre leur rentabilité en temps réel et d’adapter votre facturation à chaque dossier (qu’il soit au forfait, en régie ou à l’acte). La planification multi-collaborateurs est fluide, les tableaux de bord sont clairs et vous n’avez aucun doute sur la conformité de la solution (NF203, loi anti-fraude TVA). 

6. Horus

Horus est un logiciel d’expertise comptable développé pour les cabinets comptables qui veulent garder le contrôle sur leurs missions, leurs plannings et leur relation client. Cette plateforme 100 % cloud est accessible sur mobile, tablette ou PC. Elle centralise les échanges, les documents et le suivi des temps dans des espaces collaboratifs dédiés à chaque client. 

Vous recevez également des alertes en cas de retard ou de blocage, avec l’accès à un coffre-fort numérique avec OCR intégré : vous pouvez ainsi ajuster vos ressources en fonction du temps réellement passé. C’est une solution française, conforme RGPD, qui évolue avec vos besoins.

7. Cegid

Cegid vous propose une solution cloud complète. Avec Cegid Expert ou Loop, vous pouvez gérer la compta, la paie, la révision, les déclarations, la GED et même la facturation électronique depuis une interface unique. 

Ce logiciel pour expert-comptable intègre aussi de l’intelligence artificielle : un point positif pour automatiser les écritures et fiabiliser les données. Vos clients accèdent en autonomie à leurs espaces en ligne pour déposer leurs documents ou suivre leurs indicateurs. Cet outil est modulaire et 100 % SaaS pour vous épauler durant votre transformation digitale.

8. Welyb

Welyb, c’est le portail collaboratif qui simplifie vraiment le quotidien des cabinets. Ce logiciel de comptabilité vient centraliser tous vos outils dans une seule interface aux couleurs de votre cabinet : vous pouvez ainsi automatiser la collecte de documents (factures, bulletins, pièces sociales) et fluidifier les échanges avec vos clients grâce à une GED sur-mesure. 

On apprécie le CRM intégré, qui pense aux rappels récurrents (TVA, échéances), la plateforme qui gère la distribution des bulletins de paie ou encore la connexion à plus de 80 outils (Silae, Dext, Pennylane, etc.). Et ce logiciel de cabinet d’expert-comptable est déjà prêt pour la réforme de la facture électronique !

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9. Inqom

Inqom mise à fond sur l’intelligence artificielle pour repenser la production comptable des cabinets. Ici, pas de module social ou de gestion interne : tout est concentré sur la comptabilité, mais avec un niveau d’automatisation très poussé. 

Ce logiciel pour expert-comptable récupère les flux, génère les écritures sans paramétrage et met à votre disposition des tableaux de bord en temps réel. La révision se fait à plusieurs, avec des alertes sur les points de vigilance. 100 % français et tourné vers l’efficacité, Inqom s’adresse aux cabinets prêts à digitaliser leur production.

10. Queoval

Autre logiciel de gestion pour expert-comptable : Queoval-Expert. Cette solution tout-en-un vous aide à piloter vos missions et à garder une vision claire sur l’ensemble de votre activité. Gestion des lettres de mission, automatisation des obligations, suivi des relances, partage de documents via Google Drive, portail client en ligne : tout est pensé pour gagner du temps !

On retrouve aussi un CRM intégré, qui permet de suivre vos opportunités et vos historiques de missions d’un coup d’œil. Ce logiciel se veut comme un vrai tableau de bord quotidien pour les cabinets qui veulent rester organisés et structurer leurs process. 

11. Kanta

Kanta est spécifiquement pensé pour les cabinets comptables et commissaires aux comptes qui désirent simplifier la gestion de leurs obligations LAB. Cette solution automatise 100 % du processus : 

• récupération des infos légales (SIRET, statuts) ;
• scoring des risques en temps réel ;
• cartographie ;
• veille réglementaire ;
• suivi des échéances. 

Vous importez vos clients en quelques clics, vous assignez les dossiers à vos collaborateurs (même répartis sur plusieurs entités) et vous suivez tout depuis un tableau de bord centralisé. Et le bonus : l’hébergement est souverain, ce qui signifie que la sécurité est au rendez-vous !

12. ACD

ACD propose une suite complète pensée pour les cabinets désireux de centraliser à la fois la production et la gestion interne. Avec ce logiciel de comptabilité pour expert-comptable, vous pouvez gérer depuis une seule interface :  

• la compta ;
• le social ;
• les déclarations fiscales ;
• la relation client ;
• votre GED ;
• l’organisation du cabinet. 

Cet outil couvre aussi bien les tâches réalisées pour vos clients que votre propre fonctionnement quotidien. ACD s’impose donc comme une solution solide, conçue pour les cabinets qui préfèrent structurer toute leur activité avec un unique logiciel.

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13. Fulll

Née de la fusion d’Ibiza Software avec les solutions d’In Extenso, fulll propose une plateforme 100 % en ligne dédiée aux cabinets, entreprises et spécialistes de la paie. Deux grands modules structurent l’offre : 

1. la comptabilité (production, déclarations, dématérialisation, pilotage) ;
2. la paie (portail RH, déclaratif, bulletins). 

Moins orientée sur la gestion interne du cabinet, fulll mise sur une approche digitale fluide, accessible partout. Vos clients peuvent même consulter leurs données sur une application mobile, en temps réel. C’est donc plutôt une solution pensée pour les cabinets à la recherche d’un outil simple pour améliorer leur relation client, mais sans compromettre la qualité de l’accompagnement.

Récapitulatif des + et des – de chaque logiciel pour cabinet comptable

Oui, tout ceci fait beaucoup d’informations, nous en avons conscience ! Pour vous aider à faire votre choix au mieux, voici un petit tableau qui résume les grandes caractéristiques de chaque logiciel pour expert-comptable : 

Logiciel expert-comptable	Avantages phares	Tarif / Info tarifaire
Pennylane	Saisie, factures et notes centralisées Écriture et révision automatiques  Rapprochement bancaire fluide Interface clients (trésorerie, ventes)	Indépendants à partir de14 € / mois Entreprises (1 à 5 salariés) à partir de 29 € ou à partir de 49 € pour 6 à 15 salariés
Sage	Plateforme sur mesure pour cabinets Connectée à vos clients  CRM intégré Support et automatisation (AutoEntry, GoProposal)	Solution sur devis
EBP Comptabilité	Synchronisation bancaire Compta analytique claire (clients, projets) Trésorerie prévisionnelle Bon support client	Plans à partir de 12,50 € / mois (offres basiques), offre expert-comptable (Hubbix PRO ELITE) à environ 35,20 € / mois HT
Dext	Scan photo de documents Extraction automatisée Modules Prepare, Precision et Commerce Compatibles Sage/QuickBooks/Xero	À partir de 24 € / mois (plans payants)
Akuiteo	Module complet (compta, CRM, facturation, planning) Multi-sociétés Conformité NF203 + loi anti-fraude TVA Modules personnalisables	Solution sur devis
Horus	100 % cloud, accessible mobile Alertes planning Coffre-fort OCR Collaboration client RGPD	Offre débutant à environ 52 € / mois pour 15 dossiers (fiduciaires), hors frais d’activation/installation
Cegid	Couverture complète (compta, fiscalité, paie, GED, révision, IA) Mobile Collaboration fluide Solution sécurisée	Solution sur devis
Welyb	Portail cabinet-brandé GED & CRM intégrés Automatisation document Interconnexion à 80+ outils Support France	Solution sur devis
Inqom	Comptabilité ultra-automatisée IA Flux centralisés Écriture sans paramétrage Révision collaborative Tableaux en temps réel	Solution sur devis
Queoval‑Expert	Portail client, newsletter Suivi obligations CRM intégré Lettres de mission automatisées Centralisation sur Google Drive	10 € HT / mois par collaborateur (prix dégressif sur devis)
Kanta	Conformité LAB automatisée Import client/SIRETScoring risques en temps réel Hébergement souverain Assignation multi-entités	Solution sur devis
ACD	Suite interne complète (compta, social, GED, relation client, organisation) Produit tout-en-un pour le cabinet	Solution sur devis
fulll	Plateforme en ligne (compta + paie) Dématérialisation Accessible en mobilité via appli mobile Digital-first	Solution sur devis

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Le meilleur logiciel pour expert-comptable n’existe donc pas en soi. Ce qui compte, c’est de trouver celui qui correspond vraiment aux besoins de votre cabinet et à vos priorités. Par exemple, un cabinet qui gère 300 bulletins/mois n’aura pas les mêmes besoins qu’un cabinet 100 % BIC avec 3 collaborateurs ! Prenez donc le temps de tester chaque solution, de comparer et d’impliquer vos équipes. Vous finirez par trouver chaussure à votre pied.